Das Weiß auf der Flagge symbolisiert den Schnee auf den Berggipfeln und den Frieden, während das Hellblau für die Freiheit und den Himmel steht. Die drei Türme in der Mitte sind ein wichtiges Symbol, das die drei Festungen darstellt, die San Marino schützen.

San Marino wurde von einem Christen gegründet, der vor der Verfolgung durch das Römische Reich floh, und betrachtet „Freiheit (LIBERTAS)“ als seinen wichtigsten Wert. Dieses Wort ist ein zentraler Bestandteil der nationalen Identität und sogar auf dem Wappen eingraviert. Es symbolisiert einen kleinen, aber starken Unabhängigkeitsgeist.