El sol en el centro representa la libertad, y las tres estrellas significan las principales islas de Filipinas: Luzón, Bisayas y Mindanao. El color azul simboliza la paz y el rojo la valentía, con un profundo significado.

Lo más interesante de esta bandera es que se puede invertir. En tiempos de paz, la franja azul está arriba, pero en tiempos de guerra, la franja roja, que simboliza la valentía, se iza en la parte superior. Una bandera nacional que cambia su diseño según la situación es muy rara en todo el mundo.