این پرچم در سال ۱۹۹۴ پس از پایان آپارتاید، یعنی سیاست جدایی نژادی، به تصویب رسید. این پرچم به معنای عبور از اختلافات گذشته و ورود به دوره‌ای جدید از اتحاد است.

با اینکه شش رنگ آن معانی رسمی مشخصی ندارند، اما شامل رنگ‌هایی از پرچم‌های گذشته هلند و بریتانیا و همچنین پرچم کنگره ملی آفریقا (ANC) هستند که تلاشی برای در بر گرفتن همه شهروندان را نشان می‌دهد. این نمادی است که با روحیه بخشش و آشتی رئیس‌جمهور نلسون ماندلا آمیخته شده است.