رنگ آبی روشن در پرچم بوتسوانا نماد آب و باران، منبع حیات است، در حالی که نوارهای سیاه و سفید نشان‌دهنده هماهنگی و همزیستی نژادی است. این یک نمایش بصری از شعار ملی، «بگذار باران ببارد» است.

این پرچم همزمان با استقلال کشور در سال ۱۹۶۶ به تصویب رسید. نوارهای سیاه و سفید همچنین نماد گورخر، حیوانی رایج در این کشور، هستند که آن را به طرحی جالب تبدیل کرده و حیات وحش غنی بوتسوانا را به یاد می‌آورد.