چهار رنگ نوارها - زرد، سفید، قرمز و آبی - به ترتیب نماینده جزایر موهِلی، مایوت، آنژوان و گراند کومور هستند. هلال ماه نماد دین اصلی این کشور، یعنی اسلام است.

پرچم فعلی در سال ۲۰۰۱ به تصویب رسید و حامل معنای پیگیری اتحاد به عنوان یک دولت فدرال با احترام به خودمختاری هر جزیره است. این ایموجی آرمان‌های سیاسی و امیدهای کومور برای همزیستی هماهنگ جزایر مختلفش را نشان می‌دهد.