Matahari di tengah melambangkan kebebasan, dan tiga bintang menandakan pulau-pulau utama Filipina: Luzon, Visayas, dan Mindanao. Warna biru melambangkan perdamaian, dan merah melambangkan keberanian, yang memiliki makna mendalam.

Hal yang paling menarik dari bendera ini adalah posisinya bisa dibalik. Pada masa damai, garis biru berada di atas, tetapi pada masa perang, garis merah yang melambangkan keberanian dikibarkan di atas. Bendera nasional yang desainnya berubah sesuai situasi sangatlah langka di seluruh dunia.