Warna-warna bendera ini masing-masing melambangkan rakyat Afrika, sinar matahari, dan persaudaraan. Burung jenjang mahkota abu-abu di tengah adalah burung nasional Uganda, yang melambangkan sifatnya yang lembut.

Desain ini diadopsi bersamaan dengan kemerdekaan negara itu pada tahun 1962. Burung ini sangat terkenal karena desainnya yang unik, menghadap ke depan, yang menandakan kemajuan menuju masa depan.