Matahari di tengah melambangkan kebebasan, dan tiga bintang menandakan pulau-pulau utama Filipina: Luzon, Visayas, dan Mindanao. Warna biru melambangkan keamanan, dan warna merah melambangkan keberanian, membawa makna yang mendalam.

Perkara yang paling menarik tentang bendera ini ialah ia boleh diterbalikkan. Pada masa aman, jalur biru berada di atas, tetapi pada masa perang, jalur merah yang melambangkan keberanian, dikibarkan di atas. Bendera kebangsaan yang mengubah reka bentuknya berdasarkan situasi adalah sangat jarang di seluruh dunia.