Culorile steagului simbolizează poporul african, lumina soarelui și, respectiv, fraternitatea. Cocorul regal gri din centru este pasărea națională a Ugandei, reprezentând natura sa blândă.

Acest design a fost adoptat odată cu independența țării în 1962. Pasărea este deosebit de faimoasă pentru designul său unic, orientată spre înainte, ceea ce semnifică înaintarea spre viitor.