ธงนี้ใช้สีที่เป็นสัญลักษณ์ของอุดมการณ์รวมกลุ่มแอฟริกา สีแดงหมายถึงการปฏิวัติสังคมนิยม สีเขียวหมายถึงเกษตรกรรมและความอุดมสมบูรณ์ และดาวหมายถึงความหวังชี้นำอนาคต

ธงนี้ถูกนำมาใช้ในปี 1984 ภายใต้การนำของโธมัส ซังการา เมื่อประเทศเปลี่ยนชื่อเป็นบูร์กินาฟาโซ ซึ่งหมายถึง 'ดินแดนแห่งผู้ซื่อสัตย์' ธงนี้แฝงไปด้วยเจตจำนงอันแรงกล้าที่จะหลุดพ้นจากลัทธิล่าอาณานิคมและสร้างอนาคตใหม่