Çek bayrağındaki beyaz ve kırmızı sırasıyla Bohemya ve Moravya bölgelerini temsil ederken, mavi üçgen Slovakya'yı simgeliyordu. Bu, aslen Çekoslovakya'nın bayrağıydı.

1993'te Çekoslovakya'nın barışçıl bir şekilde dağılmasından sonra Çekya bu bayrağı kullanmaya devam etme kararı aldı. Bu durum iki ülke arasında kısa süreli bir anlaşmazlığa yol açsa da, bayrak artık Çekya'nın sembolü olarak tamamen yerleşmiş ve tarihine ilginç bir bölüm eklemiştir.