Màu xanh nhạt trên cờ Botswana tượng trưng cho nước và mưa, nguồn cội của sự sống, trong khi các sọc đen và trắng biểu thị sự hòa hợp và cùng tồn tại của các chủng tộc. Đây là sự thể hiện trực quan cho khẩu hiệu quốc gia, "Hãy có mưa".

Lá cờ này được thông qua cùng với nền độc lập của đất nước vào năm 1966. Các sọc đen và trắng cũng tượng trưng cho ngựa vằn, một loài vật phổ biến ở nước này, khiến nó trở thành một thiết kế thú vị gợi nhớ đến đời sống hoang dã phong phú của Botswana.