Các màu của lá cờ lần lượt tượng trưng cho người dân châu Phi, ánh nắng mặt trời và tình anh em. Con sếu hoàng gia xám ở trung tâm là quốc điểu của Uganda, đại diện cho bản tính hiền hòa của nó.

Thiết kế này được thông qua cùng với nền độc lập của đất nước vào năm 1962. Con chim này đặc biệt nổi tiếng với thiết kế độc đáo, hướng về phía trước, biểu thị sự tiến về tương lai.