ธงมอลโดวาเป็นธงสามสีคล้ายกับธงของโรมาเนียและชาด แต่ความแตกต่างอยู่ที่ตราแผ่นดินตรงกลาง ตราสัญลักษณ์รูปนกอินทรีที่คาบไม้กางเขนแสดงถึงเอกลักษณ์ของประเทศ

นกอินทรีในตราแผ่นดินถือช่อมะกอกซึ่งเป็นสัญลักษณ์ของสันติภาพและคทาซึ่งแสดงถึงอำนาจอธิปไตย เนื่องจากมอลโดวาขึ้นชื่อเรื่องไวน์ อิโมจินี้จึงอาจปรากฏขึ้นเมื่อคนรักไวน์พูดถึงสถานที่ท่องเที่ยวที่ไม่เหมือนใครในยุโรป