ธงนี้คล้ายกับธงของโมนาโก (🇲🇨) มาก จึงอาจทำให้สับสนได้ อย่างไรก็ตาม ธงของอินโดนีเซียจะมีความยาวในแนวนอนมากกว่าเล็กน้อย การออกแบบนี้มีต้นกำเนิดมาจากธงของจักรวรรดิมัชปาหิตในศตวรรษที่ 13

ในอินโดนีเซีย ธงนี้เรียกว่า 'ซังซากาเมราห์ปูติห์' (สีแดงขาวอันศักดิ์สิทธิ์) และถือเป็นสิ่งศักดิ์สิทธิ์ ในวันประกาศอิสรภาพ จะมีการจัดพิธีเชิญธงขึ้นสู่ยอดเสาทั่วประเทศเพื่อแสดงความภาคภูมิใจในชาติ ซึ่งเป็นพิธีกรรมสำคัญเพื่อรำลึกถึงประวัติศาสตร์อันยาวนานของการต่อสู้เพื่อเอกราชจากเนเธอร์แลนด์